Web Микроскоп видео камера C920 Linux паразит Brooklynella Аквариум конвертирование фото интервальная съемка Blender вебкамера E=mc 3D Blend4web guvcview программа Handbrake
Главная » 2017 » Ноябрь » 26 » ImageJ
11:39
ImageJ

Программа для анализа и обработки изображений.

ImageJ

Очень простой интерфейс, но большая функциональность. Вот то, что всегда пригодится: Scale bar - линейка на изображении; Measure - измерение объектов различными способами; Batch - пакетный обработчик; Множество стандартных операций над изображениями: обрезать, масштабировать, яркость/контрастность, операции с цветом...и т.д.


Scale Bar Tools for Microscope Collection

Пользоваться можно как обычной версией, так и версиями с уже предустановленными plugins. Очень нужное дополнение, отсутствующее в версиях "imagej2" и "Fiji" - это "Scale Bar Tools for Microscope Collection". Взять его можно ТУТ.Сохраняете файл .txt в папку с программой /macros/toolsets/ и перезапускаете. Теперь в панели инструментов можно выбрать новый пункт. Необходимо провести настройку: Microscope Profiles Manager Menu - Create a New Microscoe Profile. Вам будет предложено создать новый профиль с несколькими настройками - названиями и масштабами объективов.

Вот пример моих настроек.
  • Microscope profile name - Имя профиля, допустим, название микроскопа.
  • Objective - Название объектива..10, 40, 100...10х, 20х, 100х.
  • Distance in pixels - дистанция определенного отрезка (или всего изображения) в пикселах.
  • Know Distance in mk - известная длина определенного отрезка в микрометрах.
  • Default bar size - длина линейки на изображении для этого объектива.

Выберите "Straight" и измерьте уже готовый scale bar (на каком-нибудь изображении). Допустим, он равняется 10 микрометров. Измеряете и оставляете линию. Далее выбираете в меню - Analize -- Set scale. Дистанция в пикселах будет уже заполнена, осталось дать знать программе, что отрезок равен 10, а еденицы измерения um (микрометры). Буква "u" преобретёт вид греческой "микро".

Заполнив поля и сохранив значения, можно нажать на значок микроскопа в панели инструментов и выбрать настроенный профиль. Далее жмете на "Scale bar tool" и выбираете объектив, на который сделана фотография...смотрите какие пункты оставить включенными (я всё выключаю) и жмёте "OK". Изображение дублируется, но уже определённое количество пикселей равняется определённому расстоянию...можно производить измерения и добавлять масштабную линейку. Щелчок правой кнопкой мыши на значке в панели инструментов открывает его настройки. Программа может производить измерения прямой или ломаной линией, а так же присутствует "свободный режим" - рисуйте курсором и измеряйте длину.

Ещё одна замечательная функция - "Z-Project". Объединение нескольких изображений с разной глубиной фокуса. Открываем нужные изображения в программе, жмём Image -- Stacks -- Images to stack. Изображения объединятся в одном окне с переключателем снизу. Далее - Image -- Stacks -- Z-project. Пример разных настроек:

Категория: Linux | Просмотров: 252 | Добавил: Fossa | Теги: Web, измерение, программа, Микроскоп, Аквариум, наука, ихтиопатология | Рейтинг: 0.0/0
Всего комментариев: 0
avatar
Free SSL

Как со мной связаться

Если хотите написать мне, жмите кнопку.